Maartje Bastings remporte un ERC Starting Grant de 1.5 million d'euro

© 2020 EPFL

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La professeure Maartje Bastings, de la faculté des Sciences et techniques de l’ingénieur, a été récompensée par la prestigieuse subvention de démarrage du conseil européen de la recherche (CER).

Maartje Bastings, à la tête du laboratoire des biomatériaux programmables de l’institut des matériaux, a reçu une subvention pour son projet intitulé « InActioN : Intracellular Action of DNA-based Nanomaterials ». Cette subvention de 1.5 million d’euro réparti sur cinq ans encourage la recherche exploratoire menée par les chercheurs en Europe grâce à un financement compétitif dans tous les domaines, sur la base de l'excellence scientifique.

Visualisation of DNA-nanomaterials (Red) in contact with immune cells (nucleus in blue) © 2020 EPFL

« Grâce à ce fonds, mon équipe et moi-même allons pouvoir explorer la géométrie des nanomatériaux comme seul paramètre pour organiser les points de contrôle immunologique cellulaire en état actif ou inhibitif. Cela constitue une avancée sans précédent pour la recherche scientifique », explique la professeure.

Sur la base d'un réarrangement géométrique de blocs de construction identiques, son équipe de chercheurs provoquera l'activation ou l'inhibition immunitaire exclusivement par la variation de l'organisation spatiale des protéines. Le même matériau peut donc être agoniste et antagoniste selon l'organisation des composants moléculaires. Les scientifiques démontront ainsi qu'un contrôle précis de la géométrie peut définir la puissance des matériaux immunomodulateurs, ce qui ouvre la voie à l'ingénierie immunitaire basée sur la géométrie.

Concept of DNA-based nanomaterials, where DNA is folded into new geometries that can interact and perform activation within cells. The technique is called DNA-origami as it follows a similar approach as the Japanese paperart, where a 2D paper sheet is folded into new 3D geometries. © 2020 EPFL
Scientific Abstract: InActioN: Intracellular Action of DNA-based Nanomaterials
Self-organization of matter into structured architectures with emerging functionality is arguably the most important phenomenon to enable life. Unfortunately, human efforts to successfully engineer materials that control hierarchical order and achieve precise action in cells, have suffered from structural heterogeneity and limitations in functional precision. Immune pathways are prime examples of cascades where a finely balanced sequence of interactions decides between life-changing outcomes, varying from tolerance to active fight. Immune-modulating materials, therefore, would uniquely benefit from precision control over functionality. DNA-based nanomaterials have the potential to change our current bioengineering standards due to their inherent architectural uniformity and nanometer control of functionalization, allowing for a quantitative analysis of material parameters on cell activation.
The goal of this ERC proposal is to use structural geometry of DNA-based materials to provoke controlled intracellular manipulation of immune signaling via the hierarchical and spatial organization of constitutive DNA binding proteins. We create a circular paradox where DNA defines protein synthesis, yet protein function is controlled by self-organization following interaction with designer DNA. Our approach stands out in its controlled-by-nature strategy: 1) we exclusively use materials derived from cellular building blocks; that 2) respond to stimuli generated without artificial intervention, 3) that we quantify using pathway specific activation markers and 4) image via label-free microscopy to track inherent structural changes in physical material properties. We apply our approach on two important signaling pathways involved in immunology: TLR9 as Th1 trigger for vaccine adjuvants and innate cGAS inhibition to fight autoimmunity. Using spatial organization as foundation for geometry-based immune-engineering will revolutionize the design of novel immune-modulating materials.