Les mesures prises en Suisse ont fortement réduit les cas de COVID-19

Quels ont été les effets des mesures prises ces dernières semaines contre le Coronavirus ? C’est ce qu’ont voulu connaître des chercheurs de l’EPFL, analysant les mesures prises depuis le 28 février, date de l’interdiction des rassemblements de plus de 1000 personnes. Elle a été suivie par toute une série de mesures avec pour point culminant l’interdiction des rassemblements de plus de 5 personnes annoncée le 20 mars. «Les estimations de l'impact de ces mesures sur la transmission du SARS-CoV-2 sont essentielles pour la prise de décision que ce soit dans la suite de cette épidémie, ou dans les suivantes», affirme Jacques Fellay, médecin-chercheur à la Faculté des Sciences de la Vie de l’EPFL, co-auteur de l’étude et membre du comité scientifique Covid-19 mis en place par le Conseil fédéral. Les résultats de cette étude viennent d’être publiés dans la revue Swiss Medical Weekly.

La méthode utilisée consiste à déterminer l’évolution du taux de reproduction (donné par la valeur R₀) au cours de l’épidémie à l’échelle nationale et cantonale, à l’aide d’un modèle épidémiologique. Le modèle prend en compte des données détaillées de plus de 1000 patients hospitalisés dans le canton de Vaud, ainsi que les rapports publics sur les hospitalisations et les décès en Suisse. «Nous avons eu la chance d’avoir accès à des données importantes, comme la durée du séjour à l’hôpital et aux soins intensifs, ce qui n’est pas souvent le cas dans ces publications. Cela a permis d’adapter le modèle aux spécificités cliniques Suisses», souligne Joseph Lemaitre, doctorant au Laboratoire d'écohydrologie (ECHO) de l’EPFL et premier auteur de la publication.

Au niveau suisse, les chercheurs ont observé que la valeur R₀, soit le taux de reproduction, est passée de 2,8 au commencement de la pandémie à 0,4 au début avril, soit une réduction de 86%. Calculée pour chaque canton séparément, cette réduction varie entre 53% pour le Jura et 92% pour Bâle-Ville. La baisse de transmission a été comparée au changement de mobilités obtenus avec les données des téléphones mobiles. Ainsi, les déplacements liés au travail, au commerce de détail et aux loisirs ont diminué entre 50 et 75 % au niveau suisse et entre 30 et 80 % au niveau cantonal. Une corrélation très nette est observée entre la réduction du taux de reproduction et la baisse de mobilité, mais la diminution du R₀ commence quelques jours avant les premiers changements de mobilité.

Légende : Estimations des changements du taux de transmission R₀ dans le temps. Médiane : ligne pointillée, marges d’erreur intervalle interquartile et intervalle de confiance 95 % en gris foncé et gris clair. 1) Introduction de la mesure d’interdiction des rassemblements de plus de 1000 personnes, 2) Fermeture des écoles, 3) Fermeture des activités non essentielles, 4) Interdiction des rassemblements de plus de 5 personnes. / J. Lemaitre et al., SMW, 2020

Les chercheurs ont constaté que la baisse du taux de reproduction a commencé autour du 6 mars, donc au moins 1 semaine avant que la fermeture des écoles ne soit officiellement mise en place. La campagne d’information de l’Office fédéral de la santé publique lancée le 28 février et adaptée le 2 mars insistait sur les règles d'hygiène de base. Elle a provoqué une prise de conscience et une application volontaire des mesures d’hygiène et de distanciation sociale qui a permis une baisse du taux de reproduction avant même que les mesures de distanciations ne soient mises en place. «Nous avons observé que le taux de transmission était déjà autour de 1 lorsque le gouvernement fédéral a interdit les rassemblements de plus de 5 personnes et a recommandé l’isolement volontaire à domicile pour l’ensemble de la population, note Joseph Lemaitre. Ce résultat doit toutefois être replacé dans son contexte puisque l’annonce a pu être anticipée, comme on l’observe en analysant les recherches sur internet. Ce qui a probablement eu un impact sur le comportement de distanciation sociale.»

À l’aide de ce modèle, les chercheurs ont également calculé que 3,9% de la population suisse avait probablement été infectée par le virus – valeur au 24 avril. Au niveau cantonal, ce taux s’étend de 1,9% pour Berne à 16% au Tessin.

Légende : La carte montre la proportion de personnes infectées par le SARS-Cov-2 au 24 avril dans les 12 cantons suisses pour lesquels suffisamment de données étaient disponibles. Les cantons non modélisés sont indiqués en gris avec des points indiquant la proportion estimée au niveau national de 3%. / J. Lemaitre et al., SMW, 2020

Avec la levée progressive des restrictions, les chercheurs ont la volonté de publier une mise à jour quotidienne du taux de reproduction. Selon eux, il est essentiel de suivre de près son évolution, puisque la capacité de transmission du virus dépend essentiellement des comportements, et non d’une hypothétique immunité collective encore très loin d’être atteinte. «Est-ce que l’ouverture des restaurants ou des magasins entraînera une hausse des transmissions? Est-ce que celle-ci pourrait être compensée par une stratégie de dépistage et de traçage des contacts plus agressive? Quel est l’impact du port du masque? Nous n’avons pas encore la réponse à toutes ces questions : un suivi attentif des paramètres épidémiologiques est donc crucial, déclare Jacques Fellay. L’estimation du taux de reproduction en temps réel constituera un outil essentiel pour la santé publique et les décideurs politiques dans les mois à venir. Des efforts devront être faits pour affiner des modèles comme le nôtre en utilisant de nouvelles données, par exemple les résultats des études sérologiques en cours ou la description plus détaillée de l’évolution clinique des patients souffrant de COVID-19.»