Comment une protéine immunitaire est régulée dans la cellule
Des scientifiques de l’EPFL ont déterminé comment une protéine indispensable à notre première ligne de défense immunitaire est régulée dans la cellule pour prévenir les maladies auto-inflammatoires.
Comment une cellule «sait» qu’elle est infectée? C’est une question importante pour l’immunité innée, notre première ligne de défense contre toute infection ou blessure, constituée de cellules qui identifient rapidement les agents pathogènes, comme l’ADN viral. Pour ce faire, les cellules utilisent des récepteurs capables d’identifier les acides nucléiques – les éléments constitutifs de l’ADN – qui activent à leur tour une molécule de signalisation appelée STING (Stimulator of interferon genes).
Dans une cascade de «dominos» moléculaires, que les scientifiques appellent «voie de signalisation», la molécule STING commence à agir après l’enzyme GMP-AMP cyclique synthase, ou cGAS, de sorte que la voie de signalisation complète est appelée cGAS-STING. Son rôle est de détecter l’ADN étranger, provenant par exemple de bactéries ou de virus, qui a envahi la cellule.
Lorsque l’ADN étranger envahit la cellule, la voie de signalisation cGAS-STING s’active. La molécule STING quitte le réticulum endoplasmique de la cellule, où les protéines sont synthétisées, et se déplace vers l’appareil de Golgi, où les protéines subissent des modifications et des «retouches finales» avant d’être enveloppées et envoyées vers leur destination cible.
Dans l’appareil de Golgi, une enzyme fixe quelques groupes phosphates à la molécule STING – un mécanisme commun connu sous le nom de «phosphorylation» qui dynamise les protéines dans la cellule. La molécule STING commence alors à activer des gènes qui activent à leur tour les mécanismes de défense de la cellule pour combattre l’infection.
Étant donné le rôle clé de la molécule STING dans une fonction essentielle comme l’immunité innée, de nombreuses recherches ont été menées à ce sujet, notamment par le groupe d’Andrea Ablasser de la Faculté des sciences de la vie de l’EPFL. Toutefois, on sait peu de choses sur la manière dont la molécule STING est régulée et cesse d’activer les gènes. Il s’agit d’une question importante si l’on considère que la molécule STING peut entraîner de graves maladies auto-inflammatoires lorsqu’elle ne fonctionne pas.
Dans une récente étude publiée dans la revue Nature, l’équipe d’Andrea Ablasser a identifié la protéine qui met fin à l’activité de la molécule STING. Cette protéine, appelée complexe protéique adaptateur-1 (AP-1), enveloppe la molécule STING dans des vésicules, qui sont de petites capsules fermées constituées d’une bicouche lipidique comme celle qui forme la membrane cellulaire.
Les vésicules transportent généralement des matières à l’intérieur et à l’extérieur de la cellule, par exemple lors de l’endocytose et de la sécrétion respectivement. Comme la plupart des vésicules de la cellule, celles dans lesquelles l’AP-1 enveloppe la molécule STING sont recouvertes de clathrine (du latin clathrus = treillis), une protéine qui présente une forme à trois branches et se fixe à l’extérieur de la surface de la vésicule.
Les chercheuses et chercheurs ont découvert que l’AP-1 reconnaît un motif spécifique à l’extrémité côté cytosol de la molécule STING, plus précisément, deux acides aminés Leucine qui font que l’AP-1 s’engage dans la protéine. En utilisant la microscopie cryo-électronique, les scientifiques ont pu déterminer la structure de l’AP-1 et montrer qu’il régule la phosphorylation de la molécule STING, l’activant et la désactivant ainsi.
Confirmant leurs résultats, l’équipe a également montré que lorsque l’AP-1 est supprimé, les réponses immunitaires induites par la molécule STING s’aggravent. Les auteurs concluent : «Nos résultats expliquent un mécanisme structurel de régulation négative de la molécule STING et établissent que l’initiation de la signalisation est inextricablement associée à son terme pour permettre une activation transitoire de l’immunité.»
Autres contributeurs
Université de Californie, Berkeley
Fonds national suisse de la recherche scientifique
Dr. Josef Steiner, Fondation Recherche contre le cancer
Programme de recherche et d’innovation Horizon 2020 de l’Union européenne
Fondation Leenaards
Fondation Acteria
National Institutes of Health (États-Unis)
Bourses post-doctorales de l’EMBO
Ying Liu, Pengbiao Xu, Sophie Rivara, Chong Liu, Jonathan Ricci, Xuefeng Ren, James H. Hurley, Andrea Ablasser. Clathrin-associated AP-1 controls termination of STING signalling. Nature 19 October 2022. DOI: 10.1038/s41586-022-05354-0